История нашего института берет начало 16 марта 1967 года, когда в связи с развитием многих отраслей промышленного производства, строительства, сельского хозяйства и дефицитом специалистов массовых профессий был создан учебно-курсовой комбинат. Необходимость постоянного повышения безопасности производства, освоения передовых методов труда и новейших технологий производства способствовали созданию новых направлений образовательной деятельности в комбинате. А  в 1998 году он был преобразован в Башкирский учебно-методический центр профессиональной подготовки в области охраны труда и промышленной безопасности и  распоряжением кабинета Министров РБ он был определен базовым учебным заведением республики по обучению (повышению квалификации) руководителей, специалистов и рабочих, обслуживающих объекты, подконтрольные Башкирскому управлению Госгортехнадзора России, а также руководителей и специалистов в области охраны труда. В 2002 году  был переименован в институт повышения квалификации, а в 2015 году получил свое современное наимнование — ЧОУ «Межотраслевой институт».

К своему полувековому юбилею институт расширил филиальную сеть, увеличил штатный квалифицированный прподавательский состав, приобрел основательную учебно-методическую и материально-техническую базу, позволяющие учебному заведению постоянно развиваться в соответствии с велениями времени в сфере подготовки и переподготовки специалистов в области охраны труда, экологии и безопасности на производстве.

Торжественное мероприятие, посвященное 50-летие института мероприятие прошло в Национальном молодежном театре Республики Башкортостан имени  Мустая Карима. В программе были предусмотрены  поздравления и праздничный концерт.